ইসমাঈল খাঁ ছিলেন মধ্যযুগীয় বাংলার একজন অভিজাত এবং বারো-ভুঁইয়াদের সরদার ঈশা খাঁর ছোট ভাই। তিনি ষোড়শ শতকে বাংলার ভাটি অঞ্চলের সরাইলের দেওয়ান বংশ নামে পরিচিত এক অভিজাত পরিবারের সদস্য ছিলেন।
তার দাদা দেওয়ান ভগীরথ অযোধ্যার বৈস রাজপুত বংশের একজন ছিলেন এবং বাংলার সুলতান গিয়াসউদ্দীন মাহমূদ শাহের দেওয়ান হিসেবে নিযুক্ত হন। তার বাবা দেওয়ান সুলেমান খাঁ সোনারগাঁর বিখ্যাত আলেম ইব্রাহীম দানিশমন্দ সাহেবের কাছে ইসলাম গ্রহণ করেন।
ইসমাঈল খাঁর নানা, বাংলার সুলতান গিয়াসউদ্দীন মাহমূদ শাহ, পাঠান সুলতান শের শাহ সূরীর কাছে পরাজিত হন এবং বাংলা সূরী সাম্রাজ্যের একটি প্রদেশে পরিণত হয়। এরপর সরাইলের দেওয়ানরা সূরী কর্তৃত্বের বিরুদ্ধে প্রতিরোধ গড়ে তোলে এবং তার বাবাকে মৃত্যুদণ্ড দেওয়া হয়। পরবর্তীতে ইসমাঈল খাঁ ও তার ভাইকে ক্রীতদাস হিসেবে বিক্রি করা হয়।
১৫৬৩ খ্রীষ্টাব্দে কররানী রাজবংশের সময়ে ইসমাঈল খাঁর চাচা কুতুব খাঁর মাধ্যমে তিনি এবং তার ভাই আজাদ হন।